Os biomas aquáticos correspondem aos ambientes de águadoce (lagos, rios, igarapés...) e salgada (mares e oceanos). Eles são tão ricos em diversidadede espécies quanto os terrestres e também precisam ser conservados.
A maior parte do nosso planeta, mais de 70%, é constituído por água salgada. O bioma marinhoé classificado conforme a profundidade da água e das regiões iluminadas ou não pelos raios solares.
Já os biomas de água doceabrangem os córregos, lagos, lagoas, geleiras, reservatórios subterrâneos e rios.